北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心于1998年9月成立，依托于北京市農(nóng)林科學(xué)院，是北京市科委高技術(shù)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室之一。

本單位實(shí)行“開放、流動、聯(lián)合、競爭”的運(yùn)行機(jī)制，科研人員實(shí)行全員聘任制。建立固定與流動崗位相結(jié)合，按需設(shè)崗，按崗付酬，雙向選擇，競爭上崗，全員逐級聘任的新型人事制度。它是面向國內(nèi)外的開放型科研單位。

在專業(yè)研究和開發(fā)方面相對獨(dú)立，經(jīng)濟(jì)上單獨(dú)列帳，北京市農(nóng)林科學(xué)院提供行政（人事）、后勤（水、電、維修和住房等）等保障。設(shè)有流動研究人員公寓。

本單位匯聚了分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、生物化學(xué)、遺傳育種學(xué)、微生物學(xué)等學(xué)科的研究人員。現(xiàn)有固定職工32名。其中高級研究人員12名（研究員4名，副研究員8名），占總?cè)藬?shù)的1/3。國家有突出貢獻(xiàn)專家1人，博士學(xué)位者13人。24人直接參與各類研究工作。

現(xiàn)有博士生導(dǎo)師2名，碩士生導(dǎo)師8名，1個博士點(diǎn)，3個碩士點(diǎn)，一個博士后流動站。1998年-2004年中心培養(yǎng)博士研究生10人，碩士研究生30人�，F(xiàn)有10名博士生、22名碩士生在中心作研究論文工作。

在1998年-2004年期間承擔(dān)國家高技術(shù)發(fā)展計(jì)劃（863計(jì)劃）、國家轉(zhuǎn)基因植物專項(xiàng)、科技部973計(jì)劃、國家自然科學(xué)基金、科技部國際合作項(xiàng)目、北京市科技合同項(xiàng)目、北京市自然科學(xué)基金等研究課題81項(xiàng)。

目前，生物中心下設(shè)6個課題組，在中心的研究目標(biāo)總框架下，確定各課題組的主要研究方向。各課題組之間在研究方向和課題方面相對獨(dú)立，但又互有交叉和聯(lián)系，便于重大項(xiàng)目的協(xié)作和攻關(guān)。現(xiàn)設(shè)有農(nóng)作物轉(zhuǎn)基因分子育種課題組、功能基因組學(xué)課題組、園林分子生物學(xué)課題組、花卉育種與基因資源研究課題組和微生物技術(shù)課題組。