在中科院大科學裝置開放研究項目“依托種質資源庫的植物DNA條形碼研究”的支持下,中國植物條形碼研究團隊在種子植物DNA條形碼研究上取得重要進展,有關成果日前在線發(fā)表于美國《國家科學院院刊》上。
據(jù)該團隊成員、中科院昆明植物所副研究員高連明介紹,DNA條形碼是利用標準基因片段對物種進行快速和準確鑒定的新技術。線粒體細胞色素C氧化酶基因CO1已成為較理想的動物DNA條形碼。但由于植物線粒體基因進化速率較慢,篩選有效的植物DNA條形碼已成為“國際生命條形碼計劃”的首要研究任務之一。
為此,從2009年以來,中科院昆明植物研究所研究員李德銖聯(lián)合全國19個科研院所和高校,組成了中國植物條形碼研究團隊。他們對主要來自中國的種子植物75科141屬1757種共約6286個樣本進行綜合分析,發(fā)現(xiàn)三個質體DNA候選條形碼片段具有較高通用性;核糖體核DNA候選條形碼ITS在被子植物中的通用性較高,而在裸子植物中稍低。
同時,他們還發(fā)現(xiàn):ITS具有最高的物種分辨率,與三個質體DNA條形碼片段的任何一個組合均可分辨69.9%~79.1%的物種。ITS的部分序列ITS2也表現(xiàn)出較高的物種分辨率。
因此,研究團隊建議將ITS作為種子植物的核心DNA條形碼,同時強調了利用多個樣本取樣和不同遺傳方式的DNA片段開展植物DNA條形碼研究的重要性。
國際生命條形碼聯(lián)盟植物工作組主席Pete Hollingsworth認為,該論文的發(fā)表,標志著在將DNA序列數(shù)據(jù)納入植物物種水平分類和鑒定常規(guī)應用方面邁出了重要一步。
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